指名委員会等設置会社を代表するのは代表執行役であるのに対し、監査等委員会設置会社を代表するのは代表取締役である。

監査等委員会設置会社の代表機関にあたるのは代表取締役で、取締役の中から取締役会の決議により選定される（会社法362条3項）。これに対し、指名委員会等設置会社における代表機関は代表執行役であって、執行役の中から取締役会で選ばれることになっている（会社法420条1項前段）。